Cleans up a few things in CachedDirectory class:

a) Corrects doxygenated comments that were incorrectly updated
   in a prior commit, including renaming the "exts" variable to
   "allowable_exts" to make it more descriptive of what that 
   parameter expects.

b) Per Item 4 of Meyers' Effective STL, it is more efficient to
   use STL containers' empty() method over the size() method, the
   latter of which forces a recalculation of the container's size.
   So, replaces usage of size() with correlating empty() call.

c) Remove unused honor_exts boolean.